Sejak berdiri Pekon Waluyojati sudah beberapa kali di adakan pergantian Kepala Pekon yang masa jabatannya berbeda-beda antara lain :

1. Tahun 1928 s/d 1935 dipimpin oleh Bpk. KROMO SENTONO (GLONDONG).
2. Tahun 1933 s/d 1951 dipimpin oleh Bpk. HARJO PRAYITNO.
3. Tahun 1951 s/d 1952 dipimpin oleh Bpk. SARMIN.
4. Tahun 1952 s/d 1954 dipimpin oleh Bpk. ASTAR
5. Tahun 1954 s/d 1967 dipimpin oleh Bpk. PAWIRO SUMARTO.
6. Tahun 1967 s/d 1969 dipimpin oleh Bpk. MUHDI ANWAR.
7. Tahun 1969 s/d 1980 dipimpin oleh Bpk. M. MARSONO.
8. Tahun 1980 s/d 1989 dipimpin oleh Bpk. M. SULTHONI.
9. Tahun 1989 s/d 1996 dipimpin oleh Bpk. MUHTAR MISA.
10. Tahun 1996 s/d 1997 dipimpin oleh Bpk. SETRO TARUNO.
11. Tahun 1997 s/d 2006 dipimpin oleh Bpk. MASHURI.
12. Tahun 2006 s/d 2012 dipimpin oleh Bpk. PURWONO.
13. Tahun 2012 s/d 2018 dipimpin oleh Bpk. PURWONO.
14. Tahun 2018 s/d SEKARANG dipimpin oleh Bpk. GUNAWAN.